Как провести анализ человеческого генома всего за 2 часа?

Как провести анализ человеческого генома всего за 2 часа?

Учёными из Общенациональной детской больницы (США) разработан новый метод анализа, позволяющий существенно сократить время поиска в геноме человека генетических отклонений, мутаций и тех участков, которые отвечают за заболевания, передающиеся наследственным путём. По сравнению с устаревшим методом, время которого могло составлять недели, Данный вид анализа можно будет осуществить всего за 1,5-2 часа.

На первое секвенирование (определение последовательности) человеческого генома было потрачено 3 млрд. долларов и 13 лет работы. Питер Вайт, директор Центра биомедицины и геномики, утверждает, что с помощью разработанной системы полное секвенирование с последующим анализом генома человека можно будет выполнить за несколько дней. Количество специалистов, необходимое для выполнения данной задачи, по сравнению с прошлым методом, будет существенно отличаться в сторону уменьшения группы. В результате выполнения анализа учёные смогут получить упорядоченную информацию, которую практически сразу можно будет использовать для клинических испытаний.

В аналитический алгоритм «Черчилль», разработанный группой исследователями во главе с Питером Вайтом, включено самое важное из новейших вычислительных методов. Всё это оптимизировано и модернизировано для наиболее эффективного решения поставленной задачи. Данный алгоритм максимально автоматизирует аналитический процесс. Весь массив данных прогоняется через комплексную последовательность алгоритмов специализированного анализа, представляющий собой сложные вычислительные процессы. Итогом данной работы является получение списка всех генетических особенностей, в частности, генетических отклонений человека, готовой для дальнейшей обработки. Каждый шаг этого невероятно сложного процесса, по утверждению Питера Вайта, максимально оптимизирован. При работе целостность данных не нарушается и при необходимости всегда можно восстановить весь объём исходных данных.

Точность работы и эффективность алгоритма «Черчилль» подтверждён специально разработанными тестами. Результат тестирования показал следующее: точность работы алгоритма колеблется в пределах 99,7-99,99%, эффективность использования ресурсов вычислительных систем 99,66%. Стоит заметить, что алгоритм «Черчилль» может работать, используя мощности других серверов. Для сравнения, прочие системы анализа генома используют лишь около 30% от доступной мощности и работают лишь на одном единственном компьютере.

Данное открытие — это большой шаг, позволяющий возвести медицину на совершенно новый, более качественный уровень. Настанет день, когда схему лечения каждого отдельно взятого пациента будут подбирать исходя из данных его собственного генома.

  • Prev Post
  • Next Post